需與男性淋病相鑒別的疾病有：

　　(一)非淋菌性尿道炎 雖亦有不潔性交史，但潛伏期長(1～3周)，癥狀輕微，尿道分泌物量少，呈漿液性或粘液膿性。沙眼原體和解脲支原體為主要病原體，少數可由陰道毛滴蟲、念珠菌或單純皰疹病毒引起，大腸桿菌見于男性同性戀的尿道炎患者。淋球菌檢查陰性。

　　(二)非特異性尿道炎 指與性病無關的細菌性尿道炎，如繼發于包莖的尿路感染，或繼發于尿道導管插入術和其他尿道器械操作引起的損傷后感染。鏡檢常為革蘭陽性球菌。

　　(三)Reiter綜合征 主要癥狀發生次序為尿道炎、結膜炎和關節炎。發病與HLA-B相關，病因多為沙眼衣原體(性病型)、腸道福氏痢疾桿菌(腸型)。偶見于淋菌性尿道炎后發病者，尚可伴發膿溢性皮膚角化癥(掌跖多見)及環狀龜頭炎等皮膚粘膜損害。