平行志愿正在加大高中之間生源質量的差距，并形成牛校更牛，弱校更弱的分化格局。日前，媒體一則希望北京在高考中徹底推進平行志愿的報道引起了家長對北京中高考平行志愿政策的關注，本市部分高中示范校校長表示，中考平行志愿推行幾年來，高中之間生源的分數差距逐漸拉大，無形中給高中排了座次，加劇了學校強弱分化的趨勢。
　　　　名校生源分數沒有交集
　　根據北京中考平行志愿錄取規則，錄取投檔時，按考生成績從高分到低分，依次檢索考生填報的多個平行志愿學校，一旦有符合投檔條件的院校，將進行投檔。即“分分清”，一個分數的所有考生全部投檔后，才會進行下一分考生的投檔。對于考生來說，每個考生可以填報多個并列學校，增加了被錄取的機會，降低了填報志愿的風險。然而對于高中學校來說，由于考生不用擔心志愿填報過高而失去被同等學校錄取的機會，一般都填報了心目中最好的學校。最終錄取結果就變成，填報志愿最多的牛校招生后，才輪到其他學校招生。學校之間生源質量差距明顯。據了解，以海淀區為例，2008年生源最好的學校錄取分數線高出其他同等學校30分，而且生源最好學校的最后一名的中考成績超過了其他同等學校錄取的第一名。
　　　　尖子太集中不利學生發展
　　本市一位市級示范高中的校長說，北京的學生不是需要一兩所好高中，而是需要幾十所好高中。如果優質生源過度向一兩所名校集中，將影響其他學校的辦學成績，加劇高中之間的不平衡，最終受損的還是學生。一方面，高分生集中在一兩所學校里，競爭非常激烈，壓力巨大；另一方面，其他學校的優質師資在某種程度上處于“閑置”狀態。事實上，雖然頂尖名校入學成績最后一名都超過其他學校第一名，但頂尖學校的學生也并沒有100％考上清華北大，而其他學校的學生也有考上清華北大的。他說，從這點來說，學校之間的師資力量并不像家長們想象的那樣差距有多大，事實上，學生的成績8成要看學生自身素質，高分學生在其他學校可以獲得更寬松的學習環境，得到老師的關注。