微生物(Microorganism)是廣泛存在于自然界中的一群肉眼看不見，必須借助光學顯微鏡或電子顯微鏡放大數百倍、數千倍甚至數萬倍才能觀察到的微小生物的總稱。它們具有體形微小、結構簡單、繁殖迅速、容易變異及適應環境能力強等優點。

　　微生物種類繁多，至少有十萬種以上。按其結構、化學組成及生活習性等差異可分成三大類。

　　一、真核細胞型微生物　細胞核的分化程度較高，有 核膜、核仁和染色體;胞質內有完整的細胞器(如內質網、核糖體及線粒體等)。其菌屬于此類型微生物。

　　二、原核細胞型微生物　細胞核分化程度低，僅有原始核質，沒有核膜與核仁;細胞器不很完善。這類微生物種類眾多，有細菌、螺旋體、支原體、立克次體、衣原體和放線菌。

　　三、非細胞型微生物　沒有典型的細胞結構，亦無產生能量的酶系統，只能在活細胞內生長繁殖。病毒屬于此類型微生物。

　　微生物在自然界中的分布極為廣泛，空氣、土壤、江河、湖泊、海洋等都有數量不等、種類不一的微生物存在。在人類、動物和植物的體表及其與外界相通的腔道中也有多種微生物存在。

　　絕大多數微生物對人類和動、植物的生存是有益而必需的。自然界中氮、碳、硫等多種元素循環靠微生物的代謝活動來進行。例如空氣中的大量氮氣只有依靠微生物的作用才能被植物吸收，土壤中的微生物能將動、植物蛋白質轉化為無機含氮化合物，以供植物生長的需要，而植物又為人類和動物所利用。因此，沒有微生物，植物就不能新陳代謝，而人類和動物也將無法生存。

　　在農業方面，人類廣泛利用一些微生物的特性，開辟了以菌造肥、以菌催長、以菌防病、以菌治病等農業增產新途徑。在工業方面，微生物在食品、制革、紡織、石油、化工等領域的應用越來越廣泛。尤其是在醫藥工業方面，幾乎所有的抗生素都是微生物的代謝產物，另外還可利用微生物來制造一些維生素、輔酶等藥物。

　　即使是許多寄生在人類和動物腔道中的微生物，在正常情況下也是無害的，而且有的還具有拮抗外來菌的侵襲和定居，以及提供人類必需的營養物質(如多種維生素和氨基酸等)的作用。

　　有一小部分微生物能引起人類或動、植物的病害，這些具有致病性的微生物稱為病原微生物。有些微生物在正常情況下不致病，而在特定條件下可引起疾病，稱為條件性病原微生物。

　　微生物學(Microbiology)是生物學的一個分支，是研究微生物的進化、分類，在一定條件下的形態、結構、生命活動規律及其與人類、運動、植物、自然界相互關系等問題的科學。隨著研究范圍的日益擴大和深入，微生物學又逐漸形成了許多分支學科，著重研究微生物學基本問題的有普通微生物學、微生物分類學、微生物生理學、微生物生態學、微生物遺傳學、分子微生物學等。按研究對象可分為細菌學、真菌學、病毒學等。按研究和應用領域可分為農業微生物學、工業微生物學、醫學微生物學、獸醫微生物學、食品微生物學、海洋微生物學、土壤微生物學等。