慢性排斥反應屬于遲發型變態反應，發生于移植后數月甚至數年之后，表現為進行性移植器官的功能減退直至喪失;病理特點是血管壁細胞浸潤、間質纖維化和瘢痕形成，有時伴有血管硬化性改變。其機制可能為急性排斥細胞壞死的延續;炎性細胞相關的慢性炎癥;抗體和細胞介導的內皮損傷;管壁增厚和間質纖維化。

　　本型反應雖然進展緩慢，但用免疫抑制治療無明顯的臨床效果。以上屬宿主抗移植物反應(HVGR)。而移植物抗宿主反應(GVHR)多發生于同種骨髓移植者，也可見于脾、胸腺和小腸移植中;此時患者的免疫狀態極度低下，而移植物中豐富的免疫活性細胞則將受者細胞視為非己抗原，對其發生免疫應答;移植物的T細胞在受者淋巴組織中增殖并產生一系列損傷性效應。GVHR分為急性與慢性兩型。急性型多見，多發生于移植后3個月以內，患者出現肝脾腫大、高熱、皮疹和腹瀉等癥狀;雖是可逆性變化，但死亡率較高;慢性型由急性型轉來，患者呈現嚴重的免疫失調，表現為全身消瘦，多個器官損害，以皮膚和黏膜變化最突出，病人往往因嚴重感染或惡液質而死亡。

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