在各種腔道粘膜下有大量的淋巴組織聚集，稱為粘膜相關淋巴組織(MALT);其中最重要的是胃腸道粘膜相關淋巴組織(GALT)和呼吸道粘膜相關淋巴組織(BALT)。GALT包括闌尾、腸集合淋巴結和大量的彌散淋巴組織;BALT包括咽部的扁桃體和彌散的淋巴組織，構成呼吸道和消化道入口處的防御機構，稱為Waldeyer環。

　　除了消化道和呼吸道外，乳腺、淚腺、唾液腺以及泌尿生殖道等粘膜也存在彌散的MALT。

　　與淋巴結和脾不同，粘膜相關淋巴組織沒有包膜，不構成獨立的器官，通過廣泛的直接表面接觸和體液因子與外界聯系;MALT中的B細胞多為IgA產生細胞，受抗原刺激后直接將SigA分泌到附近粘膜，發揮局部免疫作用;粘膜靠一種特殊的機制吸引循環中的淋巴細胞，MALT中的淋巴細胞也可輸入到淋巴細胞再循環池，某一局部的免疫應答效果可以普及到全身的粘膜。