腫瘤標志物可存在于細胞表面、細胞質、細胞核和細胞外(血液，體液中)。腫瘤標志物的分類和命名尚未完全統一，體液中的腫瘤標志物一般分為，胚胎抗原類、糖鏈蛋白類、激素類、酶和同工酶類及癌基因產物類等。

　　1.胚胎抗原類：如AFP，CEA等，是從肝癌、結腸癌的組織中發現的，而胚胎時期的肝、胃腸管組織也能合成，并存在于胎兒的血清中，因此稱為胚胎抗原。

　　2.糖鏈抗原類：是用各種腫瘤細胞株制備單克隆抗體，來識別的腫瘤相關抗原，大多是糖蛋白或粘蛋白，如CA125，CA15-3，CA19-9等。

　　3.激素類：正常情況下不產生激素的某些組織，在發生惡變時能產生和釋放一些肽類激素(異位內分泌激素)并導致相應的征候群，因此，這些異位內分泌激素升高也可作為腫瘤相關的標志物，如小細胞肺癌可分泌促腎上腺皮質激素(ACTH)，患甲狀腺髓樣癌時降鈣素升高，患絨毛膜上皮細胞癌時hCG明顯升高。

　　4.酶和同工酶類：當機體某個部位發生腫瘤時，腫瘤細胞代謝異常，使某些酶或同工酶合成增加;或由于腫瘤組織的壓迫和浸潤，導致某些酶的排泄受阻，使腫瘤患者血清中酶活性異常升高。酶是較早發現并用于臨床診斷的一類腫瘤標志物，如患肝癌時γGT升高，患前列腺癌時PAP升高等。

　　5.蛋白質類：β2微球蛋白，鐵蛋白等在腫瘤發生時會升高;多發性骨髓瘤時本-周蛋白陽性，是臨床常用的腫瘤標志物。

　　6.癌基因產物類：癌基因的激活和抑癌基因的變異，可使正常細胞發生惡變，導致腫瘤的發生。因此，癌基因表達的蛋白可作為腫瘤標志物，如ras基因蛋白，myc基因蛋白，p53抑癌基因蛋白等。