(一)ApoAⅠ異常癥

　　Assmann分析近兩萬人，發現每500人中有1例ApoAⅠ結構基因雜合子出現，比野生型多一個或少一個正電荷或負電荷。大多數變異無明顯血脂的變化。僅有ApoAⅠMarburg病在107位上的Lys缺失，引起輕度的TG升高。ApoAⅠ的Milano變異體(173Arg→Cys)血漿中HDL有所降低，然而冠心病發病率未見增加。ApoAⅠ和ApoCⅢ基因重排導致的變異可引起家族性ApoAⅠ和ApoCⅢ缺乏癥，用EcroⅠ限制性內切酶分析ApoAⅠ基因，發現家族性早發性冠心病患者都出現6.5kb片段純合子，正常人為13kb純合子，其雜合子為13kb/6.5kb，推測純合子6.5kb與動脈粥樣硬化發病有關。

　　ApoAⅠ與ApoCⅢ缺陷者表現為血HDL水平降低，易出現早期動脈粥樣硬化。有報道ApoAⅠ減少會導致LCAT活性降低，使含ApoCⅠ、ApoAⅢ的脂蛋白如CM置換發生障礙，從而在體內蓄積。

　　(二)ApoB異常癥

　　ApoB缺陷將出現無β-脂蛋白血癥或低β-脂蛋白血癥。無β-脂蛋白血癥是純合子隱性遺傳病，稱為Bassen-Kornzeig綜合征，有脂肪吸收障礙(脂肪瀉)、紅細胞變形(棘狀紅細胞癥)和運動失調等癥狀。

　　低β-脂蛋白血癥為顯性遺傳病，雜合子者血中LDL濃度低，與無β-脂蛋白血癥有區別。經三個家族分析，患者腸粘膜細胞的ApoB48合成正常而不能合成ApoB100，即ApoB48外顯子以外的ApoB100外顯子領區異常，由于LDL受體領域附近的點突變(Arg3500→Glu)，使LDL受體結合能力降低。

　　ApoB100的羧基端是其與LDL受體的結合區，有下列依據證明這一推測：①觀察到30種單克隆抗體能與LDL受體結合的肽鏈區域結合，即ApoB100的2980-3780一段可被阻止，其他單克隆抗體無阻止作用;②縮短的ApoB異構體缺乏羧基端，則不能與LDL受體結合;③羧基端有三個區域可與肝素結合，該區域含有幾簇帶正電荷的氨基酸殘基，其中之一的序列與ApoE區域的序列有同源性，這一區域稱為ApoE區，已證實這一區域可與LDL受體結合，其序列為3359-3367氨基酸殘基位置，帶正電荷的氨基酸簇相當保守;④經化學修飾的帶正電荷的ApoB100不能與HDL受體結合;⑤若ApoB100分子中Arg→Gln3500，LDL分子不能與LDL受體結合，導致高脂蛋白血癥，如Innerarity的家族性高脂蛋白血癥。

　　ApoB100的cDNA中某一核苷酸的變異或缺失，均可引起家族性低β-脂蛋白血癥，迄今已發現有25種之多，血漿LDL濃度降低，雜合子患者血漿中ApoB和LDL濃度為正常的1/4-1/2。一般無癥狀，純合子則更為嚴重，包括脂肪吸收不良、棘型紅細胞、視網膜色素沉著和神經性肌肉退變。

　　ApoB100在血漿脂蛋白中分子量最大，氨基酸鏈最長，因此在合成蛋白質和形成脂蛋白的過程中，任何部位或環節均可能發生變異，可想而知，今后發現的ApoB100的變異會更多。

　　(三)ApoCⅡ異常癥(遺傳變異)

　　ApoCⅡ缺陷導致LPL活性降低。因為ApoCⅡ是LPL發揮催化作用不可缺少的輔因子。ApoCⅡ異常會出現高TG血癥，高CM血癥，發病率約1/10萬。現已有ApoCⅡ有多種變異體的報道。

　　(四)ApoE異常癥

　　ApoE是LDL受體的配體，其表型不同，與LDL受體結合的能力也不同，E4和E3幾乎相同，E2幾乎無結合功能。E2純合子因為第158氨基酸殘基突變，CM殘粒或β-VLDL滯留導致高Ch、TG血癥，高脂蛋白血癥，易出現早期動脈粥樣硬化。典型例子是家族性Ⅲ型高脂血癥，ε2基因純合子人群分布頻率為1%，家族性Ⅲ型高脂血癥發病率為10000人有2-3人。究其病因，ApoE2純合子遺傳缺陷因素是主要的，然而還有環境及生理性因素等的影響，如甲狀腺功能亢進、腫瘤以及家族性復合型高脂蛋白血癥等。