吸收不良綜合征由于營養物、維生素、電解質吸收障礙，引起一系列病理生理改變，主要臨床表現有：

　　一、腹瀉及其他胃腸道癥狀

　　腹瀉為主要癥狀，且最具特征。每日排便3-4次或更多，糞量多、不成形、色淡有油脂樣光澤或泡沫，有惡臭。也可為水樣瀉。少數輕癥或不典型病例可無腹瀉。伴有腹鳴、腹脹、腹部不適，但很少有腹痛。部分病人可有食欲不振及惡心、嘔吐。

　　二、營養缺乏癥狀

　　腹瀉發生后，由于蛋白質丟失及熱能供應不足，患者逐漸感乏力、消瘦、體重減輕，可出現貧血，下肢浮腫，低蛋白血癥。

　　三、維生素及電解質缺乏癥狀

　　可出現不同程度的各種維生素缺乏或電解質不足的癥狀。如維生素D及鈣的吸收障礙可有骨痛、手足搐搦、甚至病理性骨折;維生素B族吸收不良可出現舌炎、口角炎、周圍神經炎等;維生素B12葉酸及鐵吸收不良可引起貧血;鉀離子補充不足可加重無力、軟弱、生理少尿、夜尿等。

　　繼發性吸收不良綜合征除上述吸收不良表現外，還具有原發病表現。