典型病例依據臨床表現，血象及骨髓象特點可作出正確診斷，但有時尚須與下列疾病鑒別：

　　一、類白血病反應

　　類白是由于其他疾病引起反應性白細胞增高，與慢粒有許多相似之處，如白細胞總數明顯增高，外周血有幼稚細胞，也可出現脾腫大。但類白的骨髓增生程度比較輕。一般以成熟階段的中性粒細胞為主，伴有鹼性磷酸酶積分明顯增高。無Ph'染色體，可隨原發病治愈而自行緩解。

　　二、其他骨髓增生性疾病

　　CML為骨髓增生性疾病之一。該組病的共同特征是均有細胞增生且可相互轉化。但各自均有其特點，骨髓纖維化常有淚滴樣紅細胞，骨髓穿刺往往發生“干抽”，骨髓活檢可見纖維化病變。真性紅細胞增多癥，以紅細胞增生為主，粒紅比例下降，幼紅細胞出現巨幼變以及多血癥之臨床表現。原發性血小板增多癥與慢粒，雖然兩病均有巨核細胞的明顯增生，但前者常有成堆血小板圍繞在巨核細胞周圍且粒紅比例均較正常可資鑒別。

　　三、其他脾腫大性疾病

　　如黑熱病、晚期肝硬化均可有脾大，臨床常與慢粒相混淆。但血象及骨髓象可資鑒別。