1)性狀：小檗堿為黃色針狀結晶，加熱至110℃變為黃棕色，于160℃分解。鹽酸小檗堿加熱至220℃分解，生成紅棕色的小檗紅堿。

　　2)堿性：小檗堿屬季銨型生物堿，可離子化而呈強堿性，其pka值為11.50。

　　3)溶解性：游離小檗堿能緩緩溶解于水中，易溶于熱水或熱乙醇，在冷乙醇中溶解度不大。小檗堿的鹽酸鹽在水中的溶解度較小，較易溶于沸水，難溶于乙醇。小檗堿與大分子有機酸，如甘草酸、黃芩苷、大黃鞣質等結合，形成的鹽在水中的溶解度都很小。

　　4)互變異構：小檗堿一般以季銨型生物堿的狀態存在，可以離子化呈強堿性，能溶于水，溶液為紅棕色。但在其水溶液中加入過量強堿，季銨型小檗堿則部分轉變為醛式或醇式，其溶液也轉變成棕色或黃色。醇式或醛式小檗堿為親脂性成分，可溶于乙醚等親脂性有機溶劑。

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