(1)劑量過大或療程過長：尤其是使用有毒中藥或含有有毒成分的中成藥時，劑量過大或療程過長是最常見的引起中藥不良反應或藥源性疾病的因素。

　　(2)用藥不當：中醫用藥“辨證施治”，用藥不對證往往得不到應有的效果，有時反而引起不良反應。此外，誤服、亂用、給藥途徑不正確等亦常導致中藥不良反應或藥源性疾病。

　　(3)藥材品種混亂，炮制(制劑)質量欠佳：藥物質量問題，如中藥材質量、品種、產地、采收、加工、農藥殘留及炮制不規范等問題均影響飲片質量。中成藥制備方法不當或原藥材質量低劣，中藥注射劑質量欠佳等，亦可導致中藥不良反應或藥源性疾病的產生。

　　(4)中成藥組方不合理：中藥湯劑配伍不合理，中、西藥不合理聯合應用等。

　　(5)個體差異：過敏體質的病人易引起藥物過敏反應，又稱藥物變態反應，是引起中藥不良反應的重要因素。此外，病人年齡、性別、體質等情況的差異，嬰幼兒因肝腎功能發育不全，老年人則因肝腎功能衰退，對某些藥物易發生中毒，均應引起特別注意。

　　(6)管理不完善：中藥因來源于植物、動物和礦物，缺少像化學藥品那樣有一定的質量標準，因此內在質量變化很大。長期以來，我國對藥品未嚴格實施分類管理制度，一些有毒中藥材或含有毒藥成分的中成藥在流通和使用領域里未能得到嚴格控制，可被任意購買，而不加以警告或標示，以致濫用、誤用，造成中毒。有的中成藥中含有藥理作用較強的化學藥物，使病人因掌握不好劑量而出現不良反應。如消渴丸造成低血糖休克，甚至死亡，屢有報道。另外，業務人員專業素質不高，農村游醫、藥販取締不力，亦是造成中藥藥源性疾病的一個原因。