1993年11月14日，中共中央十四屆三中全會(huì)《關(guān)于建立社會(huì)主義市場經(jīng)濟(jì)體制若干問題的決定》指出：要制定各種職業(yè)資格的標(biāo)準(zhǔn)和錄用標(biāo)準(zhǔn)，實(shí)行學(xué)歷文憑和職業(yè)資格兩種證書制度。

　　此時(shí)，我國的執(zhí)業(yè)藥師資格制度正在制訂之中。

　　1994年2月22日，勞動(dòng)部、人事部聯(lián)合發(fā)布了《職業(yè)資格證書規(guī)定》，明確提出：執(zhí)業(yè)資格是政府對(duì)某些責(zé)任較大，社會(huì)通用性強(qiáng)，關(guān)系公共利益的專業(yè)(工種)實(shí)行的準(zhǔn)入控制，是專業(yè)技術(shù)人員依法獨(dú)立開業(yè)或獨(dú)立從事某種專業(yè)技術(shù)工作學(xué)識(shí)、技術(shù)和能力的必備標(biāo)準(zhǔn)。

　　此時(shí)，我國的執(zhí)業(yè)藥師資格制度已經(jīng)基本完成制訂工作，離頒布之日不到20天的時(shí)間。

　　1994年3月15日，原國家醫(yī)藥管理局與人事部聯(lián)合頒發(fā)了《執(zhí)業(yè)藥師資格制度暫行規(guī)定》，同年認(rèn)定了兩批共計(jì)1000多名執(zhí)業(yè)藥師。

　　由此開始，首先在我國西藥領(lǐng)域拉開了執(zhí)業(yè)藥師管理的序幕。

　　1995年7月5日，原國家中醫(yī)藥管理局與人事部聯(lián)合頒發(fā)了《執(zhí)業(yè)中藥師資格制度暫行規(guī)定》。同年認(rèn)定了434名執(zhí)業(yè)中藥師。

　　由此開始，在我國中西藥領(lǐng)域都展開了執(zhí)業(yè)藥師管理工作。

　　1995年10月，進(jìn)行了首次執(zhí)業(yè)藥師資格考試。

　　1996年10月，進(jìn)行了首次執(zhí)業(yè)中藥師資格考試。

　　1997年1月，《中共中央、國務(wù)院關(guān)于衛(wèi)生改革與發(fā)展的決定》又明確提出要建立執(zhí)業(yè)藥師資格制度。

　　1994至1998年這段時(shí)間，可以說是執(zhí)業(yè)藥師管理工作的起步階段。此間，執(zhí)業(yè)藥師資格制度只在藥品生產(chǎn)、經(jīng)營領(lǐng)域施行;執(zhí)業(yè)藥師的作用、重要性沒有得到足夠和廣泛的重視，藥學(xué)技術(shù)人員報(bào)考執(zhí)業(yè)藥師的積極性一度不高，執(zhí)業(yè)藥師數(shù)量增長緩慢。然而，這一階段卻為以后執(zhí)業(yè)藥師管理工作的發(fā)展打下了重要的基礎(chǔ)。

　　1998年8月，國務(wù)院機(jī)構(gòu)改革，組建了國家藥品監(jiān)督管理局，賦予其實(shí)施執(zhí)業(yè)藥師資格制度的職能，揭開了我國執(zhí)業(yè)藥師管理工作新的篇章。

　　1999年4月1日，國家藥品監(jiān)督管理局與人事部以人發(fā)[1999]34號(hào)文件聯(lián)合頒布了修訂過的《執(zhí)業(yè)藥師資格制度暫行規(guī)定》，執(zhí)業(yè)藥師資格制度實(shí)行全國統(tǒng)一大綱、統(tǒng)一考試、統(tǒng)一注冊(cè)、統(tǒng)一管理，分類執(zhí)業(yè)。《執(zhí)業(yè)藥師資格制度暫行規(guī)定》在制度上使執(zhí)業(yè)藥師管理覆蓋了藥品生產(chǎn)、經(jīng)營和使用領(lǐng)域。

　　隨后依據(jù)《執(zhí)業(yè)藥師資格制度暫行規(guī)定》，相繼修訂發(fā)布了相配套的《執(zhí)業(yè)藥師資格考試實(shí)施辦法》、《執(zhí)業(yè)藥師注冊(cè)管理暫行辦法》、《執(zhí)業(yè)藥師繼續(xù)教育管理暫行辦法》等一系列規(guī)范性文件。

　　繼1996年制定的高級(jí)職稱藥學(xué)人員雙科考試政策之后，1999年開始實(shí)行了合理下調(diào)報(bào)考人員工作年限、考試周期改為兩年等政策。在執(zhí)業(yè)藥師管理工作中，執(zhí)業(yè)藥師資格考試認(rèn)證政策更趨于科學(xué)、合理，調(diào)動(dòng)了廣大藥學(xué)技術(shù)人員報(bào)考執(zhí)業(yè)藥師的積極性。

　　此時(shí)，執(zhí)業(yè)藥師數(shù)量增長開始加快。

　　1999年10月，處方藥與非處方藥流通分類管理試點(diǎn)方案出臺(tái)，試點(diǎn)工作啟動(dòng)，深圳、無錫、棉陽三個(gè)地區(qū)和廣州、南京、北京、哈爾濱等地的部分藥品零售連鎖企業(yè)成為第一批試點(diǎn)地區(qū)和試點(diǎn)企業(yè)。