然而，目前依然存在著一個重大問題，那就是在應對突發事件時，各部門責任不夠明確、分工不夠明晰，這給統籌協調、迅速反應帶來了一定的困難，同時，各省市各部門孤軍奮戰，缺乏有效聯動、互援機制。此外，各級應急辦普遍缺乏現場指揮、調度的權力和能力，資金投入較少，也缺乏訓練有素的專業人員，應急辦的工作更加靠近值班室的值守應急、信息匯總，缺少統一指揮、跨行業調度、綜合協調的功能;最后，社會廣泛參與應對工作的機制還不夠健全，公眾的自救與互救能力還不夠強。

　　據了解，在中央層面與應急救災直接相關的就有8個部門：國務院應急辦、中國氣象局、國家地震局、水利部、林業部、農業部、民政部以及海洋局，這些部門在各地都有自成體系的應急救災體系，但在突發事件應對工作中缺少單一的應急指揮組織管理系統。

　　“快速響應、協同應對”是應急機制的核心，因此，必須打破部門分割，加快國家應急平臺建設，形成互聯互通、實時充分共享的信息交換機制。推進政府管理體制改革，避免部門職能交叉，使應急指揮機構真正具有統一組織、指揮和協調應對各種突發事件的能力

　　可喜的是，政府有關部門已經在汶川地震救災告一段落后，立即啟動了總結經驗的工作，并著手修改《突發事件應對法》。隨著一次次災害后的反思，中國在逐步向建立完善的國家突發災害應急反應機制邁進。