隨著社會的發展，在傳統體制下形成的研究生教育管理和調控機制已經不能夠很好適應新形勢下研究生教育發展的需要。

　　中國農業大學校長柯炳生說，以前的研究生培養體制有很多不合理之處：一是在國家下撥研究生培養經費有限的情況下，研究生入學時被劃分為公費生和自費生。兩類學生在繳納學費、享受獎助學金和醫療服務方面，差別較大；并且自費生無論入學后如何努力，學業如何突出，其待遇差別從入校到畢業都不能改變。二是導師招生數量的分配不合理。盡管有對導師科研情況和經費數量的要求，但是這種要求在落實上有難度、有漏洞，導致招生數量在導師之間的分配不合理，不利于培養質量的提高。三是在招生工作中，導師選拔研究生的自主權不夠充分，不利于導師責任制的落實。這些體制方面的不合理，都突出地制約了研究生培養質量的提高。所以必須進行改革。

　　改革研究生培養機制就是要進一步統籌培養單位教學、科研等方面的資源，以建立科學研究為主導的導師負責制和導師資助制為核心，改革研究生選拔機制，優化研究生培養過程，加強指導教師隊伍建設，完善研究生獎助制度，實現研究生教育規模、結構協調發展，全面提高研究生培養質量。

　　在教育部、財政部的推動和支持下，研究生培養機制改革試點工作取得了較大進展。自2006年開始，哈爾濱工業大學等3所高等學校開展了研究生培養機制改革的試點工作；2007年，實行培養機制改革的高等學校增至17所；2008年，改革已推廣到47所設置研究生院的高等學校；計劃至2009年，改革將推廣到全部中央部委屬院校，同時鼓勵各省(自治區、直轄市)選擇省屬高等學校開展改革試點工作。