將中藥的提取液經濃縮(或不濃縮)后，較長時間放置，就可析出沉淀，再經重結晶可得單體成分，這是個別現象，如從槐米中提取蘆丁。如果要得到更多的成分，或者要系統地研究一味中藥中的化學成分，則需經過比較復雜的過程，一般是經過初步分離純化，得到某一類型的總成分(混合物)，或者得到極性相近的一混合物，再經過進一步分離得到單體成分。分離方法有很多種。

　　系統溶劑分離法

　　較常用的作法是將中藥乙醇或甲醇提取液適當濃縮后，與某種擔體(如硅藻土、硅膠等)混合均勻，干燥后，用極性不同的溶劑，極性由小到大分別提取。

　　然后再選擇方法進行分離。也可以將藥材粗粉直接用極性不同的溶劑分別提取，得各個部分。

　　兩相溶劑萃取法

　　萃取法是利用混合物中各成分在互不混溶的溶劑中分配系數不同而分離的方法。可將被分離物溶于水中，用與水不混溶的有機溶劑進行萃取，也可將被分離物溶在與水不混溶的有機溶劑中，用適當pH的水液進行萃取，達到分離的目的。

　　簡單萃取法

　　在中藥成分的系統研究中，常采用的方法是將中藥水提取液適當濃縮，或將中藥乙醇 (甲醇)提取液適當濃縮，回收醇后，加入適量水，用極性不同的與水不混溶的有機溶劑，極性由小到大，如選用石油醚(或己烷)、氯仿(或乙醚)、醋酸乙酯、正丁醇，分別進行萃取，分別回收溶劑得到極性不同的萃取物。在某些情況下也可只選1～2種溶劑進行萃取。

　　分離堿性成分(生物堿)或酸性成分，可調節溶液的pH值后再進行萃取是常用的方法。

　　pH梯度萃取法

　　此法是分離生物堿類成分、酸性及酚性成分的一種方法。是利用被分離成分的堿性或酸性不同而采用的方法。

　　連續萃取法

　　為克服使用分液漏斗多次萃取的操作麻煩，可采用連續萃取器。這一儀器利用兩溶劑的比重不同，自然分層和分散相液滴穿過連續相溶劑時發生傳質。選擇連續萃取法時，需視所用溶劑的比重大于或小于被提取的水溶液比重的情況，而采用不同式樣的儀器。

　　液滴逆流分配法

　　此法需特殊的儀器，多用于極性較大的成分的分離，關鍵是選擇好固定相和流動相。

　　沉淀法

　　此法是將被分離物溶于某種溶劑中，再加入另外一種溶劑或試劑，使某種或某些成分析出沉淀，而某些成分保留在溶液中經過濾后達到分離的一種方法。可以使雜質沉淀析出，也可使欲得成分沉淀析出。

　　制藥中較常用的方法是中藥的水提取液濃縮到一定程度后，加入濃乙醇使含醇量達到一定濃度，使一些成分析出沉淀，通常為50～80%，具體含醇量視欲得到的成分的結構及性質而定。此法通常稱為“水煮醇沉法”。用此法可除去或得到多糖類等成分。

　　鉛鹽法曾被應用于分離具有酸性和中性的成分，目前已較少用。[具體操作法]

　　在中性醋酸鉛沉淀部分可得到含羧基及鄰二酚羥基的成分，如有機酸、粘液質、鞣質、某些黃酮等。堿式醋酸鉛沉淀部分得到只有一個酚羥基的成分以及中性皂苷等。經堿或醋酸鉛沉淀后的水或醇液中有中性成分。因鉛對人有害，生產中最好不用此法。

　　根據被分離成分結構選用某些特殊試劑使某些成分沉淀，經分解沉淀得欲得的成分，如水溶性生物堿的分離常用雷氏鹽沉淀法。

　　鹽析法

　　鹽析法是在中藥水提液中，加入無機鹽至一定濃度，或達飽和狀態，可使某些成分在水中溶解度降低，從而與水溶性大的雜質分離。常作鹽析的無機鹽有氯化鈉、硫酸鈉、硫酸鎂、硫酸銨等。例如自黃藤中提取掌葉防己堿，自三顆針中提取小檗堿在生產上都是用氯化鈉或硫酸銨鹽析制備。有些成分如原白頭翁素、麻黃堿、苦參堿等水溶性較大，在提取時，亦往往先在水提取液中加入一定量的食鹽，再用有機溶劑提取。

　　分餾法

　　對于完全能夠互溶的液體系統，可利用各成分沸點的不同而采用分餾法，中藥化學成分的研究工作中，揮發油及一些液體生物堿的分離即常用分餾法。例如毒芹總堿中的毒芹堿和羥基毒芹堿，前者沸點為166～167℃，后者為226℃，彼此相差較遠，即可利用其沸點的不同通過分餾法分離。

　　一般說來，液體混合物沸點相差在100℃以上，可將溶液重復蒸餾多次即可達到分離的目的，如沸點相差在25℃以下，則需采用分餾柱，沸點相差越小，則需要的分餾裝置越精細。

　　結晶法

　　結晶法是分離和精制固體成分的重要方法之一，是利用混合物中各成分在溶劑中的溶解度不同來達到分離的方法。

　　結晶法所用的樣品必須是已經用其他方法提得比較純的時候，才能采用此法精制，如果中藥的粗提取部分的純度很差，則很難得到結晶，因結晶乃同類分子自相排列，如果雜質過多，則阻礙分子的排列。

　　有些中藥成分的結晶若含有兩種以上的成分時，就可用分步結晶法使之分離。

　　結晶的純度可由化合物的晶形、色澤、熔點和熔距、薄層色譜或紙色譜等作初步鑒定。一個單體純化合物一般都有一定的熔點和較小的熔距，同時在薄層色譜或紙色譜中經數種不同展開劑系統檢定，也為一個斑點者，一般可以認為是一個單體化合物。

　　色譜法

　　定義　色譜法又稱色層法或層析法，是分離和鑒定化合物的有效方法。

　　應用

　　(1)分離混合物　在中藥提取物的有效部位中，往往含有結構相似、理化性質相似的幾種成分的混合物，用一般的化學方法很難分離，可用色譜法將它們分開。

　　(2)精制化合物　在提取、分離得到有效成分時，往往含有少量結構類似的雜質，不易除去，也可利用色譜法除去雜質得到純品。

　　(3)鑒定化合物　在一定條件下，純粹的化合物在薄層色譜或紙色譜中都有一定的Rf值，在氣相色譜和高效液相色譜中有一定的保留時間，所以利用色譜法可以鑒定化合物的純度或利用標準品的對照來初步確定兩種性質相似的化合物是否為同一物質。

　　色譜條件的選擇

　　由于中藥有效成分類型不同，性質各異，所以選擇色譜條件是不同的。

　　一般生物堿的分離可用硅膠或氧化鋁柱色譜，對于極性較高的生物堿可用分配色譜，而對季銨型水溶性生物堿也可用分配色譜或離子交換色譜。

　　苷類的色譜分離往往決定于苷元的性質，如皂苷、強心苷，一般可用分配色譜或硅膠吸附色譜。

　　揮發油、甾體、萜類包括萜類內酯，往往首選氧化鋁及硅膠色譜。

　　黃酮類化合物、鞣質等多元酚衍生物可用聚酰胺吸附色譜。

　　有機酸、氨基酸一般可選用離子交換色譜，有時也用分配色譜。有些氨基酸也可用活性炭吸附色譜。

　　對于大分子化合物，如多肽、蛋白質、多糖，常用凝膠色譜。

　　總的來說，對非極性成分往往考慮用氧化鋁或硅膠吸附色譜;若極性較大則采用分配色譜或弱吸附劑吸附色譜;對酸性、堿性、兩性成分可采用離子交換色譜，有時也可用吸附色譜及分配色譜等。