《黃帝內經》將病因分為陰陽兩類：“生于陽者，得之風雨寒暑”，“生于陰者，得之飲食、居處、陰陽、喜怒”。

　　漢代張仲景在《金匱要略》中，把病因分為三類：“經絡受邪入臟腑，為內所因”，“四肢九竅，血脈相傳，壅塞不通，為外皮膚所中”，“房室、金刃、蟲獸所傷”。

　　宋代陳無擇提出“三因學說”：外所因、內所因、不內外因。

　　近代則將病因分為五類：

　　外感病因：包括六淫(風寒暑濕燥火)和癘氣。

　　內傷病因：包括七情(喜怒憂思悲恐驚)、飲食失宜、勞逸失度。

　　繼發病因：包括痰飲、瘀血、結石。

　　其他病因：包括外傷、寄生蟲、胎傳、諸毒、醫過。

　　發病邪氣與正氣交戰，決定發病及疾病的發展變化。又稱為“正邪分爭”。

　　“邪氣”泛指各種致病因素，“正氣”指人體的自我修復調節能力、適應環境能力、抗病能力等。

　　“正氣不足”是發病的內在依據，即“邪之所湊，其氣必虛”、“正氣存內，邪不可干”。

　　體質、情志、地域、氣候等，與發病有密切關系。

　　病機病機是疾病發生、發展與傳變的機理，又稱“病理”。

　　基本病機包括：邪正盛衰、陰陽失調、氣血失常、津液代謝失常。

　　內生五邪，包括：風氣內動、寒從中生、濕濁內生、津傷化燥、火熱內生。

　　病位傳變，包括：表里出入、六經傳變、三焦傳變、衛氣營血傳變、臟腑傳變等。

　　病性轉化，包括：寒熱轉化、虛實轉化等。