三大方法研究病因，均要先形成病因假設，然后再加以驗證。流行病學形成的病因假設是根據自己的、別人的經驗，疾病的自然史，已知的影響因素等而形成。在形成病因假設時，一般可遵循下列途徑。

　　1.求同法

　　如果多種不同情況與某種疾病的存在有聯系，而在這多種情況均有一個共同的因素，則這個因素很可能為該病的病因。如氟斑牙患病率高的地區，飲水氟含量高，而患病率低處則飲水氟含量低。飲水氟含量高則可能為氟斑牙的病因。

　　2.求異法

　　如果有A、B兩種情況，某病的發病率在A顯著高于在B，在A有某因素(F)，在B沒有該因素，則F很可能是該病的病因。如肺癌發病率在吸煙者顯著高于在不吸煙者，說明吸煙可能是肺癌的病因。

　　3.共變法

　　當某個因素出現的頻度或強度發生變化時，該病發生的頻率與強度也變化，則F很可能是該病的病因。如海豹肢畸形隨反應停上市量的增減而增減。在溫州地區研究發現“散發性腦炎”的發病數，隨四咪唑和左旋咪唑上市量而變化，從而懷疑該藥物與“散發性腦炎”的發生有關。

　　4.類推法

　　當一種疾病的分布與另外一種病因已清楚的疾病的分布相似時，則這兩種病可能有共同的病因。如前文所述河北省1963年流行的“不明熱”被判斷為鉤端螺旋體病，就是根據共分布特點而作。

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