樹皮含小檗堿，木蘭花堿，黃柏堿，掌葉防已堿，內酯，甾醇等。

　　果實含賽奧林-NP36，匹西狄醇-A，尼洛替星，尼洛替星乙酸酯，二氫尼洛替星，N-甲基弗林德堿，黃柏呈，苦楝子酮，無羈萜，4，10-二亞甲基-7-異丙基-5(E)環癸烯酸。

　　葉含兒茶糖類化合物。

　　另有報道從黃皮樹皮中分離得到線型呋喃香豆精類化合物。同屬植物禿葉黃皮樹樹皮含四氫小檗堿，四氫掌葉防已堿，四氫藥根堿，黃柏堿，木蘭花堿，β-谷自甾醇。從其愈傷組織中分得小檗堿。臺灣黃檗莖和樹皮含小檗堿，非洲防已堿，藥根堿，掌葉防己堿，黃柏堿，芬氏唐松草定堿，木蘭花堿和唐松草芬寧堿。